Introdução à análise de dados em saúde com Python / Introduction to healthcare data analysis with Python

Este eBook foi elaborado no contexto do curso de capacitação Introdução à Análise de Dados em Saúde com Python ofertado pelo Centro de Inovação em Inteligência Artificial para Saúde. O curso tem como objetivo introduzir o estudo exploratório de bases de dados de saúde, com a utilização do Python. Neste eBook, procura-se apresentar uma abordagem preliminar à Ciência de Dados, que explora e descreve um conjunto de dados com técnicas da estatística descritiva e inferencial por meio da linguagem de programação Python. O público alvo que pretende-se atingir caracteriza-se por profissionais de saúde, alunos de graduação e pós-graduação, docentes e pesquisadores da área das ciências da saúde, exatas ou demais interessados em utilizar os recursos computacionais para análise de bases de dados em saúde. A linguagem Python tem se destacado como uma ferramenta poderosa para análise de dados em saúde, possuindo uma ampla gama de bibliotecas e recursos, o Python pode ser usado para limpar, processar, analisar e visualizar dados de saúde. Além disso, a comunidade de utilizadores da linguagem Python é muito colaborativa, com muitos recursos disponíveis, incluindo documentação, tutoriais e fóruns de suporte. O conteúdo foi agrupado em conceitos iniciais sobre a utilização dos dados em saúde, introdução ao Python para utilização de dados, conceitos de limpeza e tratamento de dados, aplicação da estatística descritiva com os sumários estatísticos e gráficos, técnicas de amostragens, aplicação da estatística inferencial com os testes de hipótese, de associação, de médias, de medianas e correlações, além de explorar a estilização de gráficos.

Análise dos fatores de risco cardiovascular em pacientes com doença de chagas aguda / Analysis of cardiovascular risk factors in patients with acute chagas disease

Na avaliação inicial dos pacientes com doença de Chagas não se pode ignorar a identificação dos fatores de risco cardiovascular, principalmente na fase aguda da doença. Oobjetivo foi analisar os fatores de risco cardiovascular em pacientes com doença de chagas aguda. Trata-se de um estudo retrospectivo, observacional, transversal, de fontes secundárias, em que foram revisados 160 prontuários de pacientes atendidos em dois hospitais públicos de ensino e pesquisa no período de 2009 a 2011. Dentre os 160pacientes, 89 (55,63%) eram homens, a média de idade foi de 41,59± 13,17anos. Osfatores de risco identificados como mais frequentes foram: dislipidemia 80,0%, hereditariedade 70,0%, hipertensão arterial 46,8%, IMC elevado 45,0%, diabetes 40,6%, tabagismo 45,0% e etilismo 62,5%. Oprincipal fator de risco para doença cardiovascular foi a dislipidemia, associada com a hipertensão arterial sistêmica, diabetes mellitus, obesidade e sedentarismo. Osautores concluem que os pacientes com doença de Chagas aguda compartilham os mesmos fatores de risco observados na população geral.

In the initial evaluation of patients with Chagas' disease can not ignore the identification of cardiovascular risk factors, especially in the acute phase of the disease. The objective was to analyze the cardiovascular risk factors in patients with acute Chagas disease. This is a retrospective, observational, cross-sectional study of secondary sources, which were reviewed 160 medical records of patients treated at two hospitals for teaching and research from 2009 to 2011. Among the 160patients, 89 (55.63%) were men, the average age was 41.59± 13.17years. The risk factors identified as most frequent were: dyslipidemia 80.0%, 70.0% heredity, high blood pressure 46.8%, high BMI 45.0%, 40.6% diabetes, smoking and alcohol consumption 45.0% 62 5%. The main risk factor for cardiovascular disease was the dyslipidemia associated with hypertension, diabetes mellitus, obesity and sedentary lifestyle. The authors conclude that patients with acute Chagas disease share the same risk factors observed in the general population.

Effect of female weight on reproductive potential of the predator Brontocoris tabidus (Signoret, 1852) (Heteroptera: Pentatomidae)

Este trabalho apresenta a fecundidade de fêmeas do predador Brontocoris tabidus (Signoret) (Heteroptera: Pentatomidae) de duas classes de peso, objetivando avaliar qual delas apresenta melhor produtividade em criações mantidas em laboratório. Machos e fêmeas foram alimentadas, desde o estádio ninfal, com pupas do besouro Tenebrio molitor L. (Coleoptera: Tenebrionidae). Fêmeas de B. tabidus pesando entre 95 e 150 mg e entre 160 e 220 mg constituíram as duas classes de peso. O período de oviposição e os números de posturas, de ovos e ninfas por fêmea de B. tabidus foram maiores naquelas fêmeas pertencentes à classe mais pesada, enquanto os períodos de pré-oviposição, entre posturas, incubação dos ovos e número de ovos por postura, bem como a percentagem de eclosão de ninfas e a longevidade dos adultos foram semelhantes entre ambas as classes de peso. Fêmeas mais pesadas de B. tabidus apresentaram maior número de ovos por fêmea e por esta razão devem ser utilizadas em programas de criação massal deste predador.

Reproductive potential of the predator Supputius cincticeps (Heteroptera: Pentatomidae) affected by female body weight - DOI: 10.4025/actascibiolsci.v25i1.2081 / Potencial reprodutivo de Supputius cincticeps (Stal) (Heteroptera: Pentatomidae) influenciado pelo peso do corpo da fêmea - DOI: 10.4025/actascibiolsci.v25i1.2081

The reproductive potential of Supputius cincticeps (Stal) (Heteroptera: Pentatomidae) females of two weight classes was evaluated with males and females of this predator obtained from nymphs fed on Tenebrio molitor L. (Coleoptera: Tenebrionidae) pupae. Females of S. cincticeps weighing less than 45 mg (light females) and more than 60 mg (heavy females) constituted the treatments. Pre-oviposition, oviposition and post-oviposition periods besides adult longevity were similar between treatments while number of egg masses, eggs, eggs/egg mass and number of nymphs hatched were higher for heavier females. Periods between egg mass laying and egg incubation were shorter for insects of the last treatment. These results are discussed in relation to the use of heavier females of S. cincticeps to improve mass rearing of this predator in laboratory

O potencial reprodutivo de fêmeas de Supputius cincticeps (Stal) (Heteroptera: Pentatomidae) de duas classes de peso foi avaliado. Machos e fêmeas desse predador foram obtidos de ninfas alimentadas com pupas de Tenebrio molitor L. (Coleoptera: Tenebrionidae). Foram analisadas fêmeas com peso inferior a 45 mg (fêmeas leves) e superior a 60 mg (fêmeas pesadas). A longevidade e os períodos de pré-oviposição, oviposição e pós-oviposição foram semelhantes entre fêmeas das duas classes de peso, enquanto aquelas mais pesadas apresentaram maior número de posturas, ovos, ovos/postura e ninfas. Períodos entre posturas e de incubação dos ovos foram menores para fêmeas com peso superior a 60mg. Esses resultados são discutidos em relação ao uso de fêmeas mais pesadas de S. cincticeps para aumentar a produção em criação massal desse predador

Biodiversity of frugivorous flies (Diptera: Tephritoidea) captured in citrus groves, Mato Grosso do Sul, Brazil / Biodiversidade das moscas frugívoras (Diptera: Tephritoidea) capturadas em pomares de citros, Mato Grosso do Sul

This paper presents a faunistic analysis of the frugivorous species of Tephritoidea (Diptera) captured in three citrus groves in the municipalities of Anastácio (Chácara Laranjal, 20º 31' 36'' S, 55º 50' 12'' W, 170 m) and Terenos (Chácara Suzuki, 20º 26' 12" S, 55º 04' 54'' W, 308m), MS, Brazil, during a 25 month period. McPhail traps with 5 percent hydrolyzed corn protein were hung in Citrus sinensis (L.) and C. reticulata (L.) trees, spaced 30 m apart. The Tephritidae species caught were: Anastrepha alveatoides Blanchard, A. bezzii Lima, A. castanea Norrbom, A. daciformis Bezzi, A. dissimilis Stone, A. distincta Greene, A. fraterculus (Wied.), A. grandis (Macquart), A. haywardi Blanchard, A. leptozona Hendel, A. macrura Hendel, A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. punctata Hendel, A. rheediae Stone, A. serpentina (Wied.), A. sororcula Zucchi, A. striata Schiner, A. turpiniae Stone, A. undosa Stone, A. zenildae Zucchi, three undescribed species - Anastrepha sp.1, Anastrepha sp.2; Anastrepha sp.3 and Ceratitis capitata (Wied.). The frugivorous Lonchaeidae caught were: Dasiops sp.; D. inedulis Steyskal, Lonchaea sp. and Neosilba spp. The Mediterranean Fruit Fly, C. capitata, was the most abundant and frequent, being the dominant species in the groves of both municipalities. In the Citrus grove in Anastácio the most abundant species were: Anastrepha daciformis, A. obliqua, A. pickeli, A. punctata, A. sororcula and A. fraterculus. In the Citrus groves in Terenos, A. dissimilis, A. punctata, A. sororcula, A. daciformis, A. striata and A. pickeli were the most abundant species.

Este trabalho apresenta uma análise faunística das espécies frugívoras de Tephritoidea (Diptera), capturadas em três pomares de citros dos municípios de Anastácio e Terenos-MS, durante 25 meses. Armadilhas plásticas McPhail com proteína hidrolisada de milho a 5 por cento foram penduradas em plantas de Citrus sinensis (L.) e C. reticulata (L.) a 1,70 m do nível do solo e espaçadas a 30 m. As espécies de Tephritidae capturadas foram: Anastrepha alveatoides Blanchard, A. bezzii Lima, A. castanea Norrbom, A. daciformis Bezzi, A. dissimilis Stone, A. distincta Greene, A. fraterculus (Wied.), A. grandis (Macquart), A. haywardi Blanchard, A. leptozona Hendel, A. macrura Hendel, A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. punctata Hendel, A. rheediae Stone, A. serpentina (Wied.), A. sororcula Zucchi, A. striata Schiner, A. turpiniae Stone, A. undosa Stone, A. zenildae Zucchi; três espécies não-descritas - Anastrepha sp.1, Anastrepha sp.2, Anastrepha sp.3 e Ceratitis capitata (Wied.). Os Lonchaeidae capturados foram: Dasiops sp.; D. inedulis Steyskal, Lonchaea sp. e Neosilba spp. A mosca-do-mediterrâneo, C. capitata foi a espécie mais abundante e freqüente, sendo dominante nos pomares de ambos os municípios. No pomar do município de Anastácio, as espécies mais abundantes foram: Anastrepha daciformis, A. obliqua, A. pickeli, A. punctata, A. sororcula e A. fraterculus. Nos pomares de Terenos, A. dissimilis, A. punctata, A. sororcula, A. daciformis, A. striata e A. pickeli foram as espécies mais abundantes.

Populational fluctuation of frugivorous flies (Diptera: Tephritoidea) in two orange groves in the State of Mato Grosso do Sul, Brazil / Flutuação populacional de moscas frugívoras (Diptera: Tephritoidea) em dois pomares de laranjas do Estado de Mato Grosso do Sul

This paper evaluated the capture of frugivorous flies (Tephritidae and Lonchaeidae) with plastic McPhail traps, in two commercial citrus groves, located in the municipalities of Anastácio and Terenos, in the state of Mato Grosso do Sul, Brazil. The aim of this work was to determine the populational fluctuation of adult frugivorous flies, and to study its relationship with the damaged fruits in the groves. The traps were placed about 30 m apart over the entire area in both groves, hung up approximately 1.70 m high from soil, in the canopy of the citrus plants. Eight traps were installed (two traps/ha) at Anastácio and 21 traps in Terenos (one trap/ha). The traps were baited with the hydrolyzed corn protein (5 percent) TephritidTM (food bait). Evaluations were carried out from March 22, 1994 to March 23, 1996. Ceratitis capitata (Wiedemann) and 25 species of Anastrepha were caught during several months in both orange groves, but no fruit fly species were found infesting oranges. Neosilba sp. was caught from the traps during all the experiment and was also reared from the damaged oranges, thus suggesting that that fly can be a pest. The predominant species of frugivorous flies caught in the traps were: Neosilba sp., C. capitata, Anastrepha punctata Hendel and A. sororcula Zucchi. There was no correlation between adult frugivorous flies caught in the traps and the number of larvae and adult flies reared from the infested oranges collected in the groves.

Este trabalho avaliou a captura de moscas frugívoras (Tephritidae e Lonchaeidae) com armadilhas plásticas McPhail, em dois pomares comerciais de citros, localizados nos municípios de Anastácio e Terenos, Estado de Mato Grosso do Sul. Os objetivos foram estudar a flutuação populacional dos adultos capturados nas armadilhas e verificar qual a relação entre as espécies amostradas nas armadilhas com os frutos danificados. As armadilhas foram distanciadas cerca de 30 m entre si sobre toda a área, penduradas a aproximadamente 1,70 m de altura, na copa das plantas de citros. Foram instaladas oito armadilhas (duas armadilhas/ha) no pomar em Anastácio e 21 armadilhas em Terenos (uma armadilha/ha). As armadilhas foram iscadas com a proteína hidrolizada de milho (5 por cento) TephritidMR (atrativo alimentar). As avaliações foram feitas no período de 22 de março de 1994 a 23 de março de 1996. A mosca-do-mediterrâneo Ceratitis capitata (Wiedemann) e 25 espécies de Anastrepha foram capturadas em vários meses nas armadilhas, mas não infestaram laranjas. Neosilba sp. foi capturada ininterruptamente durante os 25 meses e foi encontrada, também, nos frutos danificados amostrados nos pomares. Isso sugere que Neosilba sp. pode ter importância econômica em citros. As espécies de moscas frugívoras predominantes foram Neosilba sp., C. capitata, Anastrepha punctata Hendel e A. sororcula Zucchi. Não houve correlação entre o número de adultos de moscas frugívoras capturadas nas armadilhas com o número de larvas e de adultos criados das laranjas infestadas colhidas nos pomares.

Larval endoparasitoids (Hymenoptera) of frugivorous flies (Diptera, Tephritoidea) reared from fruits of the cerrado of the State of Mato Grosso do Sul, Brazil

This paper presents a five years survey of endoparasitoids obtained from the larvae of frugivorous Tephritidae and Lonchaeidae flies. The insects were reared from cultivated and wild fruits collected in areas of the cerrado in the State of Mato Grosso do Sul, Brazil. The flies obtained from 14 host fruit species were eight Anastrepha species, Ceratitis capitata (Wiedemann, 1824) (Tephritidae); Dasiops sp. and Neosilba spp. (Lonchaeidae). Eleven parasitoid species were collected: Braconidae - Asobara anastrephae (Muesebek, 1958), Doryctobracon areolatus (Szépligeti, 1911), D. fluminensis (Costa Lima, 1938), Opius bellus Gahan, 1930 and Utetes anastrephae (Viereck, 1913); Figitidae - Aganaspis nordlanderi Wharton, 1998, Lopheucoila anastrephae (Rhower, 1919), Odontosema anastrephae (Borgmeier, 1935) and Trybliographa infuscata Gallardo, Díaz & Uchôa-Fernandes, 2000 and, Pteromalidae - Spalangia gemina Boucek, 1963 and S. endius Walker, 1839. In all cases only one parasitoid emerged per puparium. D. areolatus was the most abundant and frequent parasitoid of fruit fly species, as was L. anastrephae in Neosilba spp. larvae. This is the first record of A. nordlanderi in the midwestern Brazilian region

Species Diversity of Frugivorous Flies (Diptera: Tephritoidea) from Hosts in the Cerrado of the State of Mato Grosso do Sul, Brazil / Diversidade de Espécies de Moscas Frugívoras (Diptera: Tephritoidea) em Hospedeiros do Cerrado do Estado de Mato Grosso do Sul

Neste trabalho foram amostradas 35 espécies de frutos do cerrado em sete municípios do estado de Mato Grosso do Sul (janeiro de 1993 a março de 1997) para avaliar a infestação por moscas frugívoras. Ocorreram espécies de seis gêneros de Tephritoidea - Anastrepha Schiner, Ceratitis MacLeay (Tephritidae); Dasiops Rondani, Lonchaea Fallén, Neosilba McAlpine (Lonchaeidae) e Notogramma Loew (Otitidae), em 29 espécies de frutos. As moscas-das-frutas (Tephritidae) colonizaram 19 hospedeiros e foram representadas por 11 espécies: Anastrepha fraterculus (Wied.), A. grandis (Macquart), A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. sororcula Zucchi, A. striata Schiner, A. turpiniae Stone, A. zenildae Zucchi, Anastrepha sp. n. e Ceratitis capitata (Wied.). De Lonchaeidae foram obtidos: Dasiops inedulis Steyskal, Dasiops spp., Lonchaea spp., Neosilba zadolicha McAlpine e Neosilba spp. As espécies de Neosilba foram as mais abundantes moscas frugívoras, ocorrendo em 22 hospedeiros. Notogramma foi o único gênero de Otitidae obtido. É discutida a associação entre moscas frugívoras e frutos hospedeiros.

Thirty-five fruit species were sampled in seven municipalities located in the cerrado of the state of Mato Grosso do Sul (January 1993 to March 1997) in a study to evaluate the infestation by frugivorous flies. Species of six genera of Tephritoidea were reared from 29 host fruits: Anastrepha Schiner, Ceratitis MacLeay (Tephritidae); Dasiops Rondani, Lonchaea Fallén, Neosilba McAlpine, (Lonchaeidae) and Notogramma Loew (Otitidae). Fruit flies (Tephritidae) were found in 19 host fruits and were represented by 11 species: Anastrepha fraterculus (Wied.), A. grandis (Macquart), A. montei Lima, A. obliqua (Macquart), A. pickeli Lima, A. sororcula Zucchi, A. striata Schiner, A. turpiniae Stone, A. zenildae Zucchi, Anastrepha n. sp. and Ceratitis capitata (Wied.). From Lonchaeidae were reared: Dasiops inedulis Steyskal, Dasiops spp., Lonchaea spp., Neosilba zadolicha McAlpine and Neosilba spp. The species of Neosilba were the most abundant, occourring in 22 host fruits. Notogramma was the only genus of Otitidae obtained. The association between frugivorous flies and the fruit species is discussed.